Pagrindinis skirtumas tarp 1D ir 2D gelinės elektroforezės yra tos savybės, kurios naudojamos baltymų atskyrimui atliekant gelinę elektroforezę. 1D gelio elektroforezė atskiria baltymus tik pagal molekulinę masę, tuo tarpu 2D gelio elektroforezė atskiria baltymus pagal jo izoelektrinį tašką ir molekulinę masę.

Baltymų atskyrimas naudojant elektroforezę geliu yra svarbi baltymų apibūdinimo technika. Baltymai turi skirtingas savybes; todėl atskyrimas yra sudėtingesnis, palyginti su DNR atskyrimu agarozės gelio elektroforezės būdu.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra 1D gelio elektroforezė
3. Kas yra 2D gelio elektroforezė
4. 1D ir 2D gelinės elektroforezės panašumai
5. Šalutinis palyginimas - 1D ir 2D gelio elektroforezė lentelės pavidalu
6. Santrauka

Kas yra 1D gelio elektroforezė?

1D gelio elektroforezė, dar žinoma kaip vienmatė gelinė elektroforezė, yra baltymų atskyrimo pagal molekulinę masę metodas. Baltymų atskyrimas daugiausia atliekamas naudojant poliakrilamido gelio elektroforezę. Remiantis gelio elektroforezės koncepcija, molekulės atskiria savo molekulinį svorį ir krūvį.

Todėl, norint vienodai įkrauti baltymus, prieš gelio elektroforezę atliekamas natrio dodecilsulfato (SDS) apdorojimas. SDS denatūruoja baltymus ir suteikia vienodą neigiamą baltymo krūvį; kai taikomas elektrinis laukas, baltymai migruoja į teigiamą galą pagal savo molekulinę masę. Taigi atskyrime nagrinėjama tik viena savybė. Štai kodėl šis metodas vadinamas 1D gelio elektroforeze.

1D gelio elektroforezės metu baltymai atskiriami pagal jų molekulinę masę. Šiuo atžvilgiu mažesnio svorio molekulės migruoja greičiau gelyje, palyginti su didelės molekulinės masės baltymais. Taigi, didelio svorio baltymai išlieka arti šulinių.

Kas yra 2D gelio elektroforezė?

2D gelio elektroforezė arba dvimatė gelinė elektroforezė atskiria baltymus pagal dvi savybes. Dvi savybės yra baltymo izoelektrinis taškas ir molekulinė masė. Šis baltymų atskyrimo būdas padidina baltymų atskyrimo skiriamąją gebą. Baltymo izoelektrinis taškas priklauso nuo pH, kuriame baltymai yra neutralūs.

Taigi, atliekant 2D gelio elektroforezę, baltymui leidžiama veikti pagal fiksuotą pH gradientą pagal pirmąjį matmenį. Antroje dimensijoje baltymai atskiriami naudojant vertikalią arba horizontalią poliakrilamido gelio elektroforezę. Taigi baltymai atsiskiria pagal savo molekulinę masę antrame matmenyje.

Be to, šis gelinės elektroforezės metodas padidina baltymų atskyrimo skiriamąją gebą. Todėl atskirti baltymai yra grynesni. Tačiau technikos kaina yra daug didesnė nei vieno matmens gelinės elektroforezės.

Kokie yra 1D ir 2D gelinės elektroforezės panašumai?

  • Abu būdai atskiria baltymus. Taigi jie yra svarbūs apibūdinant baltymus.

Kuo skiriasi 1D ir 2D gelio elektroforezė?

Pagrindinis skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės yra tas, kad 1D gelio elektroforezė atskiria baltymus tik pagal molekulinę masę, tuo tarpu 2D gelio elektroforezė atskiria baltymus pagal izoelektrinį tašką ir molekulinę masę. Dėl šio pagrindinio skirtumo tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės skiriasi ir baltymų atskyrimo skiriamoji geba bei šių dviejų metodų kaina. 2D gelio elektroforezė rodo didelę skiriamąją gebą nei 1D gelio elektroforezė. Tačiau 2D gelio elektroforezė yra brangesnė nei 1D gelio elektroforezė.

Žemiau infografijoje apibendrinamas skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės.

Skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės lentelės pavidalu

Santrauka - 1D ir 2D gelio elektroforezė

Baltymų atskyrimas priklauso nuo daugelio veiksnių. 1D gelio elektroforezė atskiria baltymus tik pagal molekulinę masę. Tačiau dviejų matmenų arba 2D gelio elektroforezė padidina baltymų atskyrimo skiriamąją gebą. Be to, 2D gelio elektroforezė atskiria baltymus pagal izoelektrinį tašką ir molekulinę masę. Todėl šie duomenys yra svarbūs perdirbant paskesnius baltymus ir proteomikos srityje. Taigi, tai yra skirtumas tarp 1D ir 2D gelio elektroforezės.

Nuoroda:

1. Galeva, Nadezhda ir MichailAltermann. „Vieno ir dvimačio gelio elektroforezės kaip žiurkės kepenų mikrosomų proteominės analizės atskyrimo įrankio palyginimas: citochromai P450 ir kiti membraniniai baltymai.“ Proteomics, JAV Nacionalinė medicinos biblioteka, 2002 m. Birželio mėn., Prieinamas čia.

Vaizdo mandagumas:

1. „Elektroforezė - 1D gelio šulinių užpildymas baltymų mišiniu“, pateikė Jean-Etienne Poirrier - 1D gelio šulinių užpildymas baltymų mišiniu (CC BY-SA 2.0) per „Commons Wikimedia“
2. „2D elektroforezė“, kurią pateikė Nacionalinis sveikatos institutas - Vėžio tyrimų nanobiologijos programos centras, Nacionalinis sveikatos institutas (viešas domenas) per „Commons Wikimedia“